Här är en uppdelning:
* kromatin: Det DNA-innehållande materialet i kärnan, fläckar ofta mörkt med basfärgämnen som hematoxylin.
* nucleoli: Täta områden i kärnan som är involverade i ribosomsyntes, fläckar ofta också mörkt.
* ribosomer: Webbplatser för proteinsyntes kan färgas med specifika färgämnen som binder till deras RNA -innehåll.
* endoplasmatisk retikulum (ER): Ett nätverk av membran involverade i proteinsyntes och lipidmetabolism. Den grova er, besatt med ribosomer, fläckar ofta mörkare än den släta ER.
* Golgi -apparaten: En serie platta säckar involverade i bearbetnings- och förpackningsproteiner kan färgas med specifika färgämnen som binder till dess membran.
* mitokondrier: Kraftverk av cellen, ansvariga för ATP -produktion. De kan färgas med färgämnen som Janus Green B.
* lysosomer: Säckliknande organeller som innehåller enzymer för cellulär matsmältning, kan färgas med specifika färgämnen som binder till sina enzymer.
* cytoplasma: Den geléliknande ämnet som fyller cellen kan färgas med olika färgämnen beroende på de cellulära komponenterna som den innehåller.
Viktig anmärkning: De specifika färgningsegenskaperna för dessa organeller beror på vilken typ av färgämne som används och den kemiska sammansättningen av organellen.
Exempel: Hematoxylin, ett grundläggande färgämne, fläckar de sura komponenterna i kärnan (som DNA) blå. Eosin, ett surt färgämne, fläckar de grundläggande komponenterna i cytoplasma (som proteiner) rosa. Det är därför du ofta ser en blå kärna och rosa cytoplasma i färgade celler.