1. Närvaro av en kärna:

* prokaryota celler: Saknar en verklig kärna. Deras genetiska material (DNA) är beläget i en region som kallas nukleoiden, som inte är innesluten av ett membran.

* eukaryota celler: Har en väl definierad kärna innesluten av ett kärnmembran, där deras DNA är organiserat i kromosomer.

2. Organeller:

* prokaryota celler: Bristande membranbundna organeller som mitokondrier, Golgi-apparat, endoplasmatisk retikulum och lysosomer. De har enklare inre strukturer.

* eukaryota celler: Ha en komplex intern organisation med en mängd membranbundna organeller som utför specialiserade funktioner.

3. Storlek:

* prokaryota celler: I allmänhet mycket mindre än eukaryota celler.

* eukaryota celler: Betydligt större, vilket möjliggör mer komplexa interna strukturer och processer.