* De har ett annat energiproduktionssystem: Bakterier har sitt eget energiproducerande system som kallas plasmamembranet . Detta membran innehåller enzymer och proteiner som utför cellulär andning och fotosyntes (i fotosyntetiska bakterier). Denna process producerar direkt ATP (adenosintrifosfat), cellens energivaluta, utan behov av mitokondrier.
* Evolutionärt ursprung: Mitokondrier tros ha sitt ursprung i endosymbios – en process där en frilevande bakterie uppslukades av en större cell och så småningom blev permanent bosatt. Det är därför mitokondrier har sitt eget DNA och replikerar oberoende. Bakterier, som är de ursprungliga prokaryota förfäderna, genomgick inte denna händelse.
* Strukturella skillnader: Bakterieceller har en enklare struktur jämfört med eukaryota celler. De saknar en verklig kärna, endoplasmatiskt retikulum, Golgi-apparat och andra komplexa organeller som finns i eukaryoter.
Sammanfattningsvis: Bakterieceller behöver inte mitokondrier eftersom de har sin egen mekanism för energiproduktion, och de utvecklades före utvecklingen av mitokondrier genom endosymbios.