I ett stort multidisciplinärt projekt, forskare vid Karolinska Institutet har utforskat olika egenskaper hos en enzymfamilj som kallas NUDIX-hydrolaser. Studien, publiceras i Naturkommunikation , avslöjar nya insikter om deras biologiska funktioner i mänskliga celler.

NUDIX-enzymerna är involverade i flera viktiga cellulära processer såsom cellulär metabolism, homeostas och mRNA-bearbetning. Även om de är mycket konserverade i alla organismer, deras individuella strukturella, biokemiska och biologiska egenskaper förblir i stort sett oklara.

För att ta itu med detta, Professor Thomas Helleday och biträdande professor Jordi Carreras-Puigvert vid Karolinska Institutets institution för medicinsk biokemi och biofysik och Science for Life Laboratory (SciLifeLab) inledde en samarbetsstudie med forskare vid Uppsala universitet, Stockholms universitet, universitetet i Ljubljana i Slovenien, och medlemmar av Human Protein Atlas.

Omfattande enzymprofilkarta

Samarbetet har resulterat i omfattande data om individuella egenskaper och inbördes samband mellan 18 mänskliga NUDIX-enzymer, avslöjar fyra stora strukturella klasser. Med hjälp av en ny algoritm, forskarna integrerade all data och skapade en omfattande NUDIX-enzymprofilkarta.

"Den här kartan avslöjar nya insikter om substratselektivitet och biologiska funktioner hos NUDIX-hydrolaser och utgör en plattform för att utöka deras användning som biomarkörer och potentiella nya cancerläkemedelsmål", säger Jordi Carreras-Puigvert.

Det multidisciplinära projektet omfattade analyser inom biokemi, strukturell biologi, funktionell genomik, genexpression, proteinuttryck och bioinformatik.