I mitokondrier äger flera exergoniska redoxreaktioner rum, vilket bidrar till genereringen av protongradienten och efterföljande ATP-syntes genom oxidativ fosforylering. En av de viktigaste exergoniska redoxreaktionerna inträffar under elektrontransportkedjan, specifikt mellan komplex I (NADH-CoQ reduktas) och komplex III (CoQH2-cytokrom c reduktas). Här är den övergripande reaktionen:

NADH (reducerad) + CoQ (oxiderad) -> NAD+ (oxiderad) + CoQH2 (nedsatt)

Denna reaktion involverar överföring av två elektroner från NADH till CoQ. När elektronerna passerar genom komplex I, kopplas de till pumpning av protoner från mitokondriella matrisen till intermembranutrymmet, vilket skapar den protongradient som är nödvändig för ATP-syntes av ATP-syntas.