Saltsystem som genererar klor kan orsaka avlagringar i pooler, vilket är ansamling av kalcium och andra mineraler på poolens ytor. Detta kan vara fult och kan även skada poolutrustningen. Avlagringar kan förhindras genom att använda en vattenavhärdare eller genom att tillsätta en kalkinhibitor till poolvattnet.

Korrosion

Kloret som genereras av saltsystem kan också orsaka korrosion av metallkomponenter i poolen, såsom värmare, filter och pump. Detta kan leda till dyra reparationer. Korrosion kan förhindras genom att använda en korrosionsinhibitor eller genom katodiskt skydd.

Kloraminer

Klor som genereras av saltsystem kan reagera med kväveföreningar i poolvattnet och bilda kloraminer. Kloraminer är inte lika effektiva för att döda bakterier som klor, och de kan också orsaka hud- och ögonirritation. Kloraminer kan avlägsnas genom att använda ett kemiskt oxidationsmedel eller med ultraviolett (UV) ljus.

Lågt pH

Saltsystem som genererar klor kan också sänka poolvattnets pH. Detta kan göra vattnet frätande och kan även orsaka hud- och ögonirritation. Lågt pH kan korrigeras genom att tillsätta en pH-höjare till poolvattnet.