En molekyl är en neutral grupp av två eller flera atomer som hålls samman av kovalenta kemiska bindningar. Till exempel är vatten (H2O) en molekyl som består av två väteatomer och en syreatom, som alla hålls samman av kovalenta bindningar.
Joniska föreningar, å andra sidan, är föreningar som består av joner, som är atomer eller molekyler som har förlorat eller fått elektroner, vilket resulterar i en elektrisk nettoladdning. Till exempel är natriumklorid (NaCl) en jonisk förening som består av positivt laddade natriumjoner (Na+) och negativt laddade kloridjoner (Cl-). Den elektrostatiska attraktionen mellan dessa motsatt laddade joner håller samman jonföreningen.
Därför, även om vissa föreningar med polära kovalenta bindningar kan vara molekyler, är inte alla föreningar med polära kovalenta bindningar molekyler. Vissa av dem är joniska föreningar.