Fritt klor avser koncentrationen av kloratomer som inte är kemiskt bundna till andra grundämnen eller föreningar i vattnet. När natriumhypoklorit tillsätts vatten, dissocierar det och bildar hypoklorsyra (HOCl), som är den primära desinfektionsmedelsarten som ansvarar för klorens desinficerande effekter. HOCl kan vidare dissociera till vätejoner (H+) och hypokloritjoner (OCl-), med de relativa proportionerna av varje art beroende på vattnets pH.
I samband med vattendesinfektion avser fritt klor specifikt koncentrationen av HOCl och OCl-joner som finns i vattnet. Närvaron av fritt klor säkerställer desinfektionseffektiviteten och kvarvarande skydd mot mikrobiell kontaminering. Därför kan natriumhypoklorit anses vara en källa till fritt klor när det tillsätts till vatten och dissocierar för att bilda HOCl.
Det är dock viktigt att notera att termen "fritt klor" även kan omfatta andra klorföreningar, såsom klorgas (Cl2) och kloraminer, som bildas när klor reagerar med kvävehaltiga föreningar i vatten. Därför kan den specifika definitionen och sammansättningen av fritt klor variera beroende på sammanhang och tillämpning.