Skillnaden i fysikaliska egenskaper mellan halogenerna beror på van der Waals-krafterna mellan molekylerna. Van der Waals krafter är svaga intermolekylära krafter som uppstår mellan alla molekyler. De orsakas av tillfälliga fluktuationer i molekylernas elektronmoln. Dessa fluktuationer skapar tillfälliga dipoler, som sedan kan attrahera eller stöta bort andra molekyler.
Styrkan hos van der Waals krafter ökar med antalet elektroner i en molekyl. Detta beror på att ju fler elektroner en molekyl har, desto mer sannolikt är det att den har en tillfällig dipol. Som ett resultat är van der Waals krafter starkast mellan stora, tunga molekyler.
Av halogenerna har jod de största och tyngsta molekylerna. Det betyder att den har de starkaste van der Waals-krafterna. Dessa starka van der Waals-krafter håller ihop jodmolekylerna, vilket gör att jod är ett fast ämne vid rumstemperatur.
De andra halogenerna har svagare van der Waals-krafter. Detta beror på att de har mindre och lättare molekyler. Som ett resultat är fluor, klor och brom alla gaser vid rumstemperatur.