Kristallstrukturen hos fluor är ansiktscentrerad kubisk (fcc). I en fcc-struktur är varje atom omgiven av tolv andra atomer, vilket bildar ett kubiskt arrangemang. Fluoratomerna är ordnade i ett regelbundet, upprepande mönster, där varje atom upptar en specifik position inom kristallgittret. Denna struktur är vanlig bland metaller, såsom aluminium, koppar och nickel, men finns vanligtvis inte i icke-metalliska element som fluor.