Antalet väteatomer jämfört med syreatomer i en aminosyra kan variera beroende på den specifika aminosyran. Men i genomsnitt innehåller aminosyror vanligtvis fler väteatomer jämfört med syreatomer. Detta beror på att aminosyrastrukturen består av en central kolatom bunden till en aminogrupp (-NH2), en karboxylgrupp (-COOH), en sidokedja (R) och en väteatom. Aminogruppen innehåller två väteatomer, medan karboxylgruppen innehåller en syreatom. Sidokedjan (R) kan variera i struktur och sammansättning och kan bidra med ytterligare väteatomer.
Till exempel har glycin, den enklaste aminosyran, formeln NH2-CH2-COOH. Den innehåller fyra väteatomer och två syreatomer. Å andra sidan har asparagin, en annan aminosyra, formeln NH2-CH(CH2-CONH2)-COOH. Den innehåller åtta väteatomer och tre syreatomer.
I allmänhet tenderar aminosyror att ha ett högre förhållande mellan väteatomer och syreatomer på grund av närvaron av väteatomer i aminogruppen och de variabla sidokedjorna. Det exakta antalet väte- och syreatomer kan dock variera mellan olika aminosyror.