* bindningsstyrka: Peptidbindningarna i proteiner är relativt starka och kräver betydande energi för att bryta. Däremot är fosfodiesterbindningarna i nukleinsyror svagare och mer mottagliga för hydrolys.
* Struktur: Proteiner har en mer kompakt och stabil tredimensionell struktur, som skyddar peptidbindningarna från attack med syra. Nukleinsyror har å andra sidan en mer öppen och flexibel struktur, vilket gör deras fosfodiesterbindningar mer tillgängliga för hydrolys.
* känslighet för pH: Proteiner tål ett bredare intervall av pH -värden än nukleinsyror. Medan båda molekylerna är känsliga för extrema pH -tillstånd, är nukleinsyror särskilt sårbara för nedbrytning vid lågt pH (sura förhållanden). Detta beror på att den sura miljön kan protonera fosfatgrupperna i nukleinsyror, vilket gör dem mer mottagliga för hydrolys.
Sammanfattningsvis: Proteiner är mer resistenta mot sur hydrolys än nukleinsyror på grund av de starkare peptidbindningarna, mer stabil struktur och högre tolerans för sura miljöer.