Ja, den systematiska positionen för _Archaeopteryx_ har utmanats de senaste åren. Traditionellt har _Archaeopteryx_ ansetts vara ett övergångsfossil mellan dinosaurier och fåglar, baserat på dess kombination av dinosaurier och fågeldrag. Vissa nya studier har dock föreslagit att _Archaeopteryx_ kanske inte är en direkt förfader till moderna fåglar, utan istället kan vara en nära släkting till dinosaurierna _Deinonychus_ och _Velociraptor_.

Ett av huvudargumenten mot den traditionella synen på _Archaeopteryx_ som en direkt förfader till fåglar är det faktum att den saknar några av de nyckelegenskaper som är karakteristiska för moderna fåglar. Till exempel har _Archaeopteryx_ en lång benig svans, medan moderna fåglar har korta svansar i pygostil. _Archaeopteryx_ har också tre fingrar på varje vinge, medan moderna fåglar bara har två.

Ett annat argument mot den traditionella synen på _Archaeopteryx_ är det faktum att den har hittats i samma geologiska formation som _Compsognathus_, en liten köttätande dinosaurie som inte är nära besläktad med fåglar. Detta tyder på att _Archaeopteryx_ kan ha levt tillsammans med dinosaurier, snarare än att vara en direkt förfader till fåglar.

Trots dessa utmaningar förblir den systematiska positionen för _Archaeopteryx_ en diskussionsfråga. Vissa forskare tror fortfarande att _Archaeopteryx_ är ett övergångsfossil mellan dinosaurier och fåglar, medan andra tror att det är en nära släkting till dinosaurierna _Deinonychus_ och _Velociraptor_. Ytterligare forskning behövs för att lösa denna debatt.