Genomsekvenserna av två "falska" koraller erbjuder ett fönster till utvecklingen av förkalkning, vilket kan hjälpa deras revbyggande kusiner.
Svamppolyper. Koraller för elefantöron. Skivsippor. Vad du än vill kalla dem – forskare föredrar korallimorfer – dessa akvarieryggradslösa djur är bland de närmast kända släktingarna till koraller som bygger rev. Ett team ledd av forskare från Red Sea Research Center vid KAUST har nu sekvenserat hela genomen från två sådana "nakna" korallarter, så kallade eftersom de inte lägger ner kalciumkarbonatskelett.
DNA-kartor erbjuder ett fönster till utvecklingen av förkalkning och kan hjälpa forskare att rädda världens korallrev från utrotning.
"Detta är de första genomen som publicerats från denna grupp av organismer, sa Manuel Aranda, en biträdande professor i marin vetenskap vid KAUST som ledde genomprojektet. "Resurserna och analysen vi tillhandahåller är grunden för framtida studier som syftar till att förstå hur koraller utvecklade förmågan att bygga ett av de mest produktiva och biologiska mångfaldiga ekosystemen på vår planet."
Aranda slog sig ihop med forskare vid Scientific Center of Monaco för att extrahera DNA från vävnadsprover av Amplexidiscus fenestrafer och Discosoma sp., två korallimorfer med en form som liknar marksvampar. Xin Wang, en Ph.D. student i Arandas labb, arbetade sedan med tekniker på KAUST Bioscience Core Facility för att sekvensera, sätta ihop och kommentera båda arternas genom. De hittade alla gener i corallimorph genomen genom att leta efter sekvenslikhet med kända gener som finns i andra arters genom, inklusive två havsanemoner och en korall.
På det här sättet, de bekräftade att korallimorfer är de närmaste levande släktingarna till koraller som bygger rev, tillhandahålla en välbehövlig genomisk resurs för att fylla det evolutionära gapet mellan havsanemoner och koraller. De visade också att A. fenestrafer-genomet är cirka 370 miljoner DNA-bokstäver långt med 21, 372 gener och att genomet hos A. Discosoma är 445 miljoner nukleotider långt med 23, 199 gener. Dessa storlekar ligger mellan de för havsanemoner och koraller, överensstämmer med den evolutionära historien och komplexiteten hos denna taxonomiska gruppering.
Forskare överallt kan nu fritt komma åt och bläddra i både nya corallimorph-genomkartor via en onlineplattform tillgänglig på corallimorpharia.reefgenomics.org.
Aranda hoppas att forskarvärlden kommer att använda genomsekvenserna för att bättre förstå det evolutionära ursprunget för generna som gjorde det möjligt för koraller att bli de ekosystembyggare de är idag. I hans labb, till exempel, Aranda och hans team undersöker de evolutionära innovationer som koraller var tvungna att göra för att förvärva förmågan att förkalka. "Än så länge, sa Wang, "Vi har hittat flera gener involverade i förkalkning som har unikt duplicerats i koraller."
