Ett mikroskops upplösning är inte detsamma som dess förstoring. Upplösningen är det minsta avståndet mellan två punkter som mikroskopet kan urskilja som separata. Förstoringen är storleken på bilden jämfört med storleken på objektet.

Till exempel kan ett mikroskop med en förstoring på 400x ha en upplösning på 1 mikrometer (µm). Det betyder att mikroskopet kan skilja mellan två punkter som är 1 µm från varandra.

Ett mikroskops upplösning bestäms av flera faktorer, inklusive våglängden på det använda ljuset, kvaliteten på linserna och mängden avvikelser i det optiska systemet.