RNA-molekyler är viktiga för genuttryck, och fungerar som budbärare som bär genetisk information från DNA till cellens proteintillverkningsmaskineri. Vissa RNA-molekyler är dock mycket kortlivade, existerar bara i några sekunder eller minuter, vilket gör dem utmanande att studera.
Den nya tekniken, kallad SLAM-seq (för kortlivad RNA-analys av Mate-Pair Sequencing), övervinner denna utmaning genom att använda en kombination av kemisk märkning och sekvensering med hög genomströmning för att fånga och identifiera kortlivade RNA-molekyler.
Med hjälp av SLAM-seq kunde forskarna identifiera tusentals kortlivade RNA-molekyler i mänskliga celler och analysera deras uttrycksmönster. De fann att dessa kortlivade RNA är involverade i en mängd olika cellulära processer, inklusive celltillväxt, differentiering och apoptos.
Forskarna upptäckte också att uttrycket av kortlivade RNA är tätt koordinerat med aktiviteten av RNA-polymeras II, enzymet som transkriberar DNA till RNA. Detta tyder på att kortlivade RNA spelar en viktig roll för att reglera gentranskription.
Den nya tekniken ger ett kraftfullt verktyg för att studera kortlivade RNA:s roll i cellulära processer och kan leda till utvecklingen av nya terapier för sjukdomar som orsakas av störningar i RNA-metabolismen.
Studien publiceras i tidskriften Nature.
