1. Proteinmedierad DNA-förpackning :
- I vissa DNA-virus, som bakteriofager som T4-fagen, packas genomet in i kapsiden genom inverkan av specialiserade proteiner. Dessa proteiner, som kallas DNA-förpacknings-ATPaser, binder till specifika DNA-sekvenser och använder energi från ATP-hydrolys för att trycka in DNA-molekylen i kapsiden.
2. Spoolning :
- Spooling är en mekanism som observeras i vissa RNA-virus, som HIV-1. Under viral sammansättning transkriberas RNA-genomet aktivt till en lång enkelsträngad RNA-molekyl. Denna RNA-molekyl spolas sedan in i en konisk eller cylindrisk struktur, styrd av nukleokapsidproteiner. Det spolade RNA:t bildar en kompakt kärna omgiven av den virala kapsiden.
3. Rulning och stapling :
– I vissa virus packas arvsmassan genom en kombination av spolnings- och staplingsinteraktioner. Till exempel, i herpesvirus, genomgår det dubbelsträngade DNA-genomet lindning och bildar en toroid- eller ringliknande struktur. Detta toroidala DNA stabiliseras ytterligare genom interaktioner med virala proteiner, vilket gör att genomet kan passa effektivt in i kapsiden.
4. Nukleosomliknande strukturer :
– Vissa DNA-virus, som adenovirus, paketerar sitt genom till strukturer som liknar nukleosomer, som är protein-DNA-komplex som finns i eukaryota celler. Det virala DNA:t associerar med virala histoner och bildar nukleosomliknande partiklar som kondenserar genomet och skyddar det från nedbrytning.
5. Glykoproteiner :
- Glykoproteiner som finns på virushöljet kan bidra till genomkondensering i vissa virus. Genom att interagera med det virala genomet hjälper dessa glykoproteiner till att organisera och stabilisera det genetiska materialet i virionen.
6. Proteinrockar och skal :
- I vissa virus som rotavirus kan en proteinhölje omsluta den kondenserade nukleinsyrakärnan. Denna proteinhölje är flexibel och tillåter kärnan att kondensera och expandera, vilket säkerställer effektiviteten av viral replikation och överföring.
7. Fasövergång :
– I vissa RNA-virus som influensa A-virus har forskare föreslagit att genomet genomgår en fasövergång från flytande till geltillstånd under förpackningen. En sådan tillståndsförändring tillåter genomet att anta ett kompakt och ordnat arrangemang.
Det är viktigt att notera att de specifika mekanismerna för genomkondensering kan variera beroende på virala arter, genomstruktur och monteringsvägar. Virusens förmåga att effektivt paketera sin genetiska information inom ett begränsat utrymme är avgörande för deras överlevnad, replikering och överföring i olika miljöer och värdar.
