1. Genuttryck: Olika alleler kan leda till olika nivåer av genuttryck, vilket i sin tur kan påverka fenotypen hos en individ. Till exempel kan vissa individer ha ett högre uttryck av en gen som kodar för en tillväxtfaktor, vilket kan leda till ökad tillväxt.
2. Proteinfunktion: Olika alleler kan också leda till olika proteinfunktioner. Till exempel kan vissa individer ha en mutation i en gen som kodar för ett protein som är involverat i ämnesomsättningen, vilket kan leda till förändringar i hur kroppen bearbetar maten.
3. Reglerande element: Genetisk variation kan också påverka aktiviteten hos regulatoriska element, som är DNA-sekvenser som styr uttrycket av gener. Till exempel kan vissa individer ha en mutation i ett regulatoriskt element som leder till överuttryck av en gen, vilket kan ha en betydande inverkan på individens fenotyp.
4. Epigenetik: Epigenetik avser förändringar i genuttryck som inte orsakas av förändringar i själva DNA-sekvensen. Dessa förändringar kan orsakas av en mängd olika faktorer, såsom miljöfaktorer, och kan leda till individuella skillnader inom en art. Till exempel kan vissa individer ha en högre nivå av DNA-metylering, vilket kan leda till minskat genuttryck, medan andra kan ha en lägre nivå av DNA-metylering, vilket kan leda till ökat genuttryck.
5. Gen-miljö-interaktioner: En individs genetiska bakgrund kan också interagera med miljön för att skapa individuella skillnader. Till exempel kan vissa individer vara mer mottagliga för vissa miljögifter, medan andra kan vara mer resistenta.
Det komplexa samspelet mellan genetisk variation, genuttryck, proteinfunktion, regulatoriska element, epigenetik och gen-miljö-interaktioner ger upphov till det stora utbudet av individuella skillnader som vi ser inom en art.