Yttermembran: Det yttre membranet av E. coli är sammansatt av ett lipopolysackaridskikt som fungerar som en fysisk barriär mot magsyra.
Effluxpumpar: E. coli innehåller effluxpumpar som gör det möjligt för den att pumpa ut protoner (H+) ur cellen och bibehålla ett neutralt pH inuti cytoplasman. Utflödet av protoner skapar en alkalisk mikromiljö runt bakterierna som skyddar den från syraskador.
pH-homeostas: E. coli har syraresistensgener som kodar för proteiner som är involverade i att upprätthålla pH-homeostas. Dessa proteiner hjälper bakterierna att anpassa sig till miljöer med lågt pH genom att reglera inre pH och förhindra försurning av cytoplasman. Detta system reglerar upptaget av vissa lösta ämnen som glutamat och arginin för att buffra internt pH.
Biofilmbildning: I vissa fall kan E. coli bilda biofilmer – skyddande samhällen av bakterier som växer på ytor. Biofilmer är mer resistenta mot magsyra jämfört med enskilda bakterieceller, eftersom den extracellulära matrisen som produceras av biofilmen fungerar som en barriär mot syrapenetration.
Genom att använda dessa mekanismer kan E. coli överleva passage genom den sura miljön i magen och nå de mer gästvänliga förhållandena i tarmen, där den kan föröka sig och orsaka infektion.