Proteiner är viktiga för livet. De utför en mängd olika funktioner, inklusive att katalysera kemiska reaktioner, transportera molekyler och tillhandahålla strukturellt stöd. Hur proteiner viker sig till sina funktionella former är en grundläggande fråga inom biologi.
I en ny studie har forskare vid University of California, Berkeley, gett bevis för en mekanism som kallas "kärnbildning-kollaps". Nukleation-kollaps föreslår att proteiner viker sig genom att först bilda en liten, stabil kärna av aminosyror. Denna kärna växer sedan genom att dra till sig andra aminosyror, vilket får proteinet att kollapsa till sin slutliga form.
Forskarna testade sin hypotes med ett protein som kallas grönt fluorescerande protein (GFP). GFP är ett litet protein som lyser grönt när det utsätts för blått ljus. Forskarna konstruerade en version av GFP som innehöll en enda aminosyrasubstitution. Denna substitution gjorde att proteinet mer sannolikt bildade en stabil kärna.
Forskarna fann att den konstruerade GFP:n veks mycket snabbare än vildtyps-GFP. Detta tyder på att kärnbildningskollaps är en nyckelmekanism för proteinveckning.
Resultaten av denna studie har implikationer för att förstå hur proteiner felveckas. Proteinfelveckning kan leda till en mängd olika sjukdomar, inklusive Alzheimers sjukdom och cystisk fibros. Genom att förstå hur proteiner viker sig kan forskare kanske utveckla nya läkemedel för att förebygga eller behandla dessa sjukdomar.
Studien publicerades i tidskriften Nature Structural &Molecular Biology.