Sekvensen i mRNA som kompletterar DNA-mallen kallas kodningssträngen. Det är strängen av mRNA som är komplementär till schablonsträngen av DNA. Mallsträngen är den DNA-sträng som används som mall för syntes av mRNA. Den kodande strängen är den sträng av mRNA som faktiskt översätts till protein.

Den kodande strängen av mRNA är komplementär till mallsträngen av DNA genom att baserna på mRNA-strängen är komplementära till baserna på DNA-strängen. Till exempel, om mallsträngen av DNA har sekvensen 5'-ACTGATC-3', kommer den kodande strängen av mRNA att ha sekvensen 3'-UGACUAG-5'.

Den kodande strängen av mRNA är viktig eftersom det är strängen av mRNA som faktiskt översätts till protein. Ribosomen läser av sekvensen av baser på den kodande strängen av mRNA och använder denna information för att syntetisera ett protein. Sekvensen av baser på den kodande strängen av mRNA bestämmer sekvensen av aminosyror i proteinet.