Vid elektrofores placeras ett prov som innehåller en blandning av molekyler i en gel eller ett membran och en elektrisk ström passerar genom det. Molekylerna i provet kommer att migrera genom gelén eller membranet i olika hastigheter beroende på deras laddning och storlek. Positivt laddade molekyler (katjoner) kommer att migrera mot den negativa elektroden (katoden), medan negativt laddade molekyler (anjoner) kommer att migrera mot den positiva elektroden (anoden). Mindre molekyler kommer att migrera snabbare än större molekyler.
När molekylerna migrerar genom gelén eller membranet kommer de att bilda distinkta band. Varje band representerar en specifik molekyl eller grupp av molekyler som har liknande egenskaper. Placeringen av ett band på gelén eller membranet motsvarar molekylens laddning och storlek.
Utseendet och antalet band i en elektroforetisk separation kan ge värdefull information om provets sammansättning och egenskaper. Elektrofores används i stor utsträckning inom olika områden, inklusive biokemi, molekylärbiologi, genetik och kriminalteknisk vetenskap, för separation, identifiering och karakterisering av molekyler.
Till exempel i proteinelektrofores representerar band olika proteiner som har separerats baserat på deras laddning och storlek. Genom att analysera bandmönstren kan forskare identifiera och studera specifika proteiner i ett prov, upptäcka proteinavvikelser eller modifieringar och bestämma proteinkoncentrationer. På liknande sätt representerar band i DNA-elektrofores olika DNA-fragment som har separerats baserat på deras storlek. Denna teknik används ofta i DNA-fingeravtryck, genetisk testning och faderskapsanalys.
