* ribosomala RNA (rRNA) gener: Dessa gener är viktiga för proteinsyntes och är mycket bevarade över olika organismer. Jämförelse av rRNA -sekvenser kan avslöja djupa evolutionära relationer.
* Andra mycket konserverade gener: Gener som är involverade i viktiga cellulära processer, som DNA -replikation och transkription, är också bra kandidater för jämförelse.
Varför inte andra molekylära jämförelser?
* proteiner: Även om proteinsekvenser kan ge information om relationer, är de mer benägna att utvecklas snabbt och visa mindre djupa evolutionära anslutningar än DNA -sekvenser.
* kolhydrater: Medan svampar, växter och djur har olika cellväggstrukturer och kolhydratkompositioner, är dessa skillnader inte lika informativa för att bestämma djupa evolutionära förhållanden som DNA -sekvenser.
* lipider: Lipider är mycket olika och inte särskilt användbara för att jämföra avlägsna evolutionära relationer.
vad man kan förvänta sig:
Jämförelse av DNA -sekvenser av nyckelgener kommer att avslöja att svampar är närmare besläktade med djur än till växter . Detta kan verka överraskande, men det stöds av en stor mängd bevis från olika områden, inklusive molekylärbiologi, cellstruktur och biokemi.
Obs: Även om jämförelse av DNA -sekvenser är den mest pålitliga metoden, kan andra molekylära jämförelser, som proteinstrukturer eller metaboliska vägar, ge kompletterande information.