Vissa kodoner betraktas emellertid föredragna kodoner i en viss organisme eller celltyp. Dessa föredragna kodoner används oftare i proteinsyntes, och de kan vara mer effektiva i översättning. Faktorer som påverkar kodonpreferensen inkluderar:
* Arter: Olika arter har olika föredragna kodoner.
* Gene: Inom en art kan olika gener ha olika föredragna kodoner.
* celltyp: Även inom samma organisme kan olika celltyper ha olika föredragna kodoner.
Varför finns föredragna kodoner?
* tRNA -överflöd: Celler har olika mängder olika tRNA -molekyler. Kodoner som motsvarar mer rikliga tRNA är i allmänhet föredragna.
* Översättningseffektivitet: Vissa kodoner är mer effektiva när det gäller att översättas än andra. Detta kan bero på strukturen för tRNA eller interaktionen med ribosomen.
Exempel på föredragna kodoner:
* Hos människor, aug är det vanligaste startkodonet och uag , uaa och uga är de vanligaste stoppkodonerna.
* För aminosyran leucin, CuA är ett mindre föredraget kodon jämfört med uua eller cug .
Slutsats:
Medan alla 64 kodoner är giltiga föredras vissa framför andra beroende på faktorer som arter, gen och celltyp. Dessa föredragna kodoner är mer effektivt översatta och bidrar till den totala effektiviteten hos proteinsyntes.
