Här är varför:

* gram-positiva bakterier Ha ett tjockt peptidoglykansskikt i sin cellvägg. Detta skikt fångar kristallviolettfärgämnet som används i färgningsprocessen, vilket gör att bakterierna verkar lila.

* gram-negativa bakterier Ha ett tunnare peptidoglykansskikt och ett yttre membran. Det tunnare peptidoglycanskiktet behåller inte kristallviolett färgämne också, så det tvättas bort under avfärgningssteget. Men dessa bakterier tar sedan upp prognosen (Safranin), vilket gör att de verkar rosa.

Därför differentierar gramfärgningstekniken bakterier baserat på deras cellväggstruktur, särskilt tjockleken på det peptidoglykanskiktet.