Både bakterier och archaea klassificeras som prokaryoter, vilket innebär att de saknar en membranbunden kärna och andra membranbundna organeller. Deras genetiska material (DNA) är beläget i en region som kallas nukleoiden, som inte är innesluten av ett membran.
Eukaryoter har å andra sidan en kärna som innehåller deras DNA. Detta är en viktig skillnad mellan prokaryoter och eukaryoter.