Icke-autonoma transponerbara element (TE) är fascinerande DNA-bitar som kan röra sig inom ett genom, men de kan inte göra det ensamma. De förlitar sig på närvaron av autonoma TES, som bär nödvändiga gener för transposition.
Här är en uppdelning:
vad de är:
* DNA -sekvenser som kan röra sig inom ett genom men saknar gener för transposition. Detta innebär att de är beroende av närvaron av autonoma TE:er för deras rörlighet.
* De innehåller ofta rester av transposasgener eller reglerande element. Dessa rester är ofta inaktiva eller ofullständiga, men de har fortfarande informationen för transposasenzymet, vilket är nödvändigt för transposition.
Varför de kallas "icke-autonoma":
* de behöver hjälp från andra element. De förlitar sig på det transposas som produceras av autonoma TE:er för att röra sig.
* De är i huvudsak parasitiska. De utnyttjar maskinerna i de autonoma TE:erna att sprida sig inom genomet.
typer av icke-autonoma TE:
* trunkerade element: Dessa har tappat en del av sin transposasgen, vilket gör att de inte kan producera enzymet.
* icke-kodande element: Dessa saknar alla funktionella transposasgener men kan innehålla reglerande sekvenser som kan användas av autonoma TE:er.
* "Solo LTR" Elements: Dessa är rester av retrotransposoner som har tappat sina inre gener men behåller de långa terminala upprepningarna (LTR), som kan erkännas och användas av andra element för transposition.
Hur de rör sig:
1. De är beroende av transposas från en autonom TE. Detta transposas känner igen specifika sekvenser (ofta resterna av transposasgener eller reglerande element) inom den icke-autonoma TE.
2. Transposaset skär den icke-autonoma TE från dess ursprungliga plats.
3. Det skurna elementet sätts in på en ny plats inom genomet.
Påverkan på genomet:
* De kan bidra till genomutveckling och plasticitet. Även om de kan störa gener och orsaka mutationer, kan de också införa nya sekvenser, vilket kan leda till genetisk mångfald.
* De kan ha en roll i genreglering. Icke-autonoma TE:er kan interagera med reglerande element i genomet och påverkar genuttryck.
* De kan tjäna som hotspots för rekombination. Deras upprepade sekvenser kan underlätta rekombinationshändelser, vilket kan leda till genomarrangemang.
Exempel:
* AC/DS -system i majs: AC (autonomt) element producerar det transposas som behövs för att DS (icke-autonomt) elementet ska röra sig.
* p element i Drosophila: P-elementet kan vara antingen autonomt eller icke-autonomt, beroende på närvaron av transposasgenen.
Sammantaget:
Icke-autonoma TE:er är fascinerande exempel på genetiska parasiter som utnyttjar maskinerna för andra element för att sprida sig inom genomet. De bidrar till genomutveckling och plasticitet, men de kan också orsaka störningar och mutationer. Att förstå deras mekanismer och påverkan är avgörande för att dechiffrera komplikationerna i genomdynamiken.
