Medan vissa enzymer är gjorda av RNA (ribozymer), är den stora majoriteten av enzymer proteiner. Proteiner är stora, komplexa molekyler som består av kedjor av aminosyror. Den specifika sekvensen av aminosyror bestämmer den unika tredimensionella formen hos ett protein, som i sin tur dikterar dess funktion. Enzymer fungerar som katalysatorer och påskyndar biokemiska reaktioner utan att konsumeras under processen. Deras komplexa strukturer tillåter dem att binda till specifika molekyler (substrat) och underlätta kemiska transformationer.