1. membranbundna organeller: Eukaryota celler har en komplex inre struktur med olika membranbundna organeller, såsom kärnan, mitokondrier, endoplasmatisk retikulum, Golgi-apparat och lysosomer. Dessa organeller delar upp cellulära funktioner och möjliggör effektivare och specialiserade processer. Prokaryota celler, å andra sidan, saknar dessa organeller och deras funktioner utförs av plasmamembranet och cytoplasma.
2. En sann kärna: Eukaryota celler har en väl definierad kärna innesluten av ett dubbelmembran som kallas kärnhöljet. Kärnan innehåller cellens genetiska material, DNA, i form av kromosomer. Prokaryota celler saknar en verklig kärna och deras DNA är beläget i en region som kallas nukleoiden, som inte är innesluten av ett membran.
