* biologi: Studera celler, vävnader och mikroorganismer
* Medicin: Diagnostisera sjukdomar, undersöka blod och andra kroppsvätskor och utföra operation
* kemi: Observera kemiska reaktioner, analysera material och studera kristallstrukturer
* Materialvetenskap: Undersöka materialets struktur och egenskaper
* geologi: Analysera stenar, mineraler och fossil
* Engineering: Inspektera kvaliteten på tillverkade delar och komponenter
* Forensic Science: Undersöker bevis som fibrer, hår och fingeravtryck
* jordbruk: Studera växter, skadedjur och sjukdomar
I huvudsak är alla fält där detaljerna om små objekt är viktiga förlitar sig på mikroskopi.