Homologa kromosomer är ett par kromosomer, ett ärvt från varje förälder, som delar samma gener på samma loci (platser på kromosomen). Medan de bär samma gener, kan de specifika versionerna eller allelerna av dessa gener skilja sig mellan de två kromosomerna. Detta innebär att homologa kromosomer har den genetiska informationen för samma egenskaper, men kan ha olika instruktioner för dessa egenskaper.