De första klassificeringssystemen, som Aristoteles, fokuserade främst på djur och växter . De var till stor del baserade på observerbara egenskaper, och mikroorganismer var helt enkelt för små för att ses med blotta ögat.

Därför mikroorganismer , inklusive bakterier, svampar, protister och virus, saknade från dessa tidiga klassificeringar.

Det var först med uppfinningen av mikroskopet på 1600 -talet som forskare började upptäcka och klassificera dessa mikroskopiska organismer.