Ett team av forskare använde matematik för att förutsäga vilka områden av SARS-CoV-2 spikproteinet som mest sannolikt kommer att mutera. Kredit:Jill Hemman/ORNL, U.S. Dept. of Energy
Oak Ridge National Laboratory, University of Tennessee i Chattanooga och Tuskegee University forskare använde matematik för att förutsäga vilka områden av SARS-CoV-2 spikproteinet som mest sannolikt kommer att mutera.
I en studie publicerad i Polymers , analyserade teamet topologin för mer än 13 000 proteindatabankstrukturer och fann att mutationer i virusets spikprotein var mest sannolikt att inträffa i områden med hög topologisk fri energi, vilket gör ett protein mindre stabilt.
SARS-CoV-2 omicron-varianten muterades i ett område som överensstämmer med forskarnas beräkningar, vilket bekräftar uppsatsens resultat.
Denna metod gör det möjligt för forskare att förutsäga var proteinmutationer kan uppstå med hjälp av matematik och kan tillämpas på vilket protein som helst, vilket potentiellt öppnar dörren för bättre förståelse av viral dynamik och effektivare läkemedelsterapier.
"Vi tror att tillvägagångssättet är virusoberoende", säger ORNL:s Bobby Sumpter. "Det är allt baserat på topologin hos proteiner." + Utforska vidare
