* Kärnreaktorer: Plutonium-239 är den vanligaste isotopen av plutonium som används i kärnreaktorer. Det används som bränsle i både termiska och snabba neutronreaktorer.

* Kärnvapen: Plutonium-239 används också vid tillverkning av kärnvapen. Det är det primära klyvbara materialet i atombomber.

* Radioisotop termoelektriska generatorer (RTG): Plutonium-238 används som värmekälla i RTG. RTG:er används för att tillhandahålla elektrisk kraft till rymdfarkoster, satelliter och andra fjärrtillämpningar.

* Medicinska applikationer: Plutonium-238 används också i vissa medicinska tillämpningar, såsom produktion av radiofarmaka och behandling av cancer.