Nej, molekyler är inte alltid lika i en kemisk ekvation. En kemisk ekvation representerar en kemisk reaktion, där utgångsmaterialen (reaktanterna) omvandlas till olika ämnen (produkter). Lagen om bevarande av massa säger att den totala massan av reaktanterna måste vara lika med den totala massan av produkterna. Däremot kan antalet molekyler av varje ämne ändras under reaktionen.

Tänk till exempel på följande kemiska ekvation:

$2H_2 + O_2 \högerpil 2H_2O$

I denna ekvation reagerar två molekyler vätgas ($H_2$) med en molekyl syrgas ($O_2$) för att producera två molekyler vatten ($H_2O$). Antalet väteatomer är bevarat, eftersom det finns fyra väteatomer på båda sidor av ekvationen. Antalet syreatomer är också bevarat, eftersom det finns två syreatomer på båda sidor av ekvationen. Antalet molekyler är dock inte bevarat, eftersom det finns tre molekyler på vänster sida av ekvationen och två molekyler på höger sida av ekvationen.

I allmänhet kan antalet molekyler för varje ämne i en kemisk ekvation ändras under reaktionen, men den totala massan av reaktanterna måste vara lika med den totala massan av produkterna.