* kol (c)
* väte (H)
* syre (O)
* kväve (n)
Dessa fyra atomer bildar ryggraden i aminosyramolekylerna som kopplas samman för att skapa proteiner.
Förutom dessa fyra huvudatomer kan proteiner också innehålla små mängder andra atomer, såsom:
* svavel (S) :Finns i aminosyran cystein och involverad i disulfidbindningar.
* fosfor (P) :Finns i vissa modifierade aminosyror.
Dessa ytterligare atomer finns emellertid inte i alla proteiner och är mindre vanliga än de fyra primära atomerna.