Öns namn kommer från bahamansk tall (Pinus caribaea var. bahamensis), som en gång var en vanlig art på ön. Tallbeståndet på ön har dock ödelagts av flera orkaner, inklusive orkanen Donna 1960 och orkanen Andrew 1992. Som ett resultat är ön nu hem för mestadels tallstubbar, och de fåtal kvarvarande tallarna är ofta hämmade eller sjuklig.
Trots förlusten av sina träd med samma namn har ön fortfarande kvar sitt namn, Big Pine Key. Detta beror troligen på det faktum att ön fortfarande är känd för sin historia av tallavverkning och dess koppling till tallindustrin, även om tallarna inte längre är en stor närvaro på ön.