En ung flicka som heter Lyra, född och uppvuxen på Eden, längtar efter ett liv utöver gränserna för hennes kupoltäckta stad. Hon drömmer om den enorma, otämda vildmarken som sträcker sig bortom det skimrande kraftfältet, en plats viskade om i trasiga toner som en rike av mytiska varelser och glömd teknik.
Lyras farfar, en känd botaniker, hade en passion för den glömda världen bortom kupolen. Han berättade för henne historier om livliga, självlysande flora, om varelser som sjöng i skymningen och om de forntida, kristallina strukturerna som förmodligen hade nyckeln till jordens glömda historia.
En dag upptäcker Lyra en dold passage under hennes farfars verkstad. Det leder till ett tunnelsystem begravt djupt inom jorden, en som hennes farfar hade tillbringat sitt liv på att studera. Tunneln slutar i en kammare, badad i ett mjukt, annat världsligt ljus. I mitten, inbäddat på en piedestal, sitter en skimrande kristallsfär.
Drivet av en törst efter äventyr och önskan att avslöja sanningen bakom hennes farfars forskning berör Lyra sfären. Kammaren vibrerar, kristallpulserna och en våg av energi tvättar över henne. När ljuset sjunker befinner hon sig på en plats till skillnad från allt hon någonsin har sett.
Luften är tung med doften av exotiska blommor, och himlen är en väv av livliga färger. Varelser med iriserande vingar flit genom luften, och höga träd hum med en svag, rytmisk takt. Lyra snubblar på en förstörd stad, dess strukturer byggda av samma kristallina material som sfären.
Detta, inser hon, är den sanna Eden, en värld där vetenskap och magi sammanflätade. Hon lär sig att de forntida människorna som byggde denna stad utnyttjade kristallernas kraft för att skapa en harmonisk samexistens mellan teknik och natur. Men något, hon vet ännu inte vad, ledde till deras undergång.
När Lyra utforskar denna glömda värld, avslöjar hon hemligheterna i dess förflutna och kristallernas dolda potential. Men hon står också inför faror som lurar i skuggorna, varelser som försöker utnyttja kristallerna för sina egna avskyvärda syften.
Beväpnad med sin farfars kunskap och sitt eget nyfundna mod, måste Lyra navigera i denna konstiga, vackra värld, avslöja det förflutna mysterierna och kämpa för en framtid där vetenskap och fantasi kan samexistera, precis som i Eden som hon nu kallar hem.