Tumörkärl är ett viktigt mål för cancerbehandlingar. Rieger, Fredrich och Welter vid Saarlands universitet, Tyskland har bedrivit en kvantitativ analys av de fysikaliska determinanterna för vaskulariserade tumörer i flera år. Med hjälp av datasimuleringar har de kunnat sammanfatta kunskapen från in vitro -forskning av tumörsferoider, djurmodeller och kliniska studier och har återskapat ett vaskulariserat tumörsystem i siliko.

De har nyligen släppt tumörkod, en mjukvara som samlar flera kända modeller till ett mångsidigt tillvägagångssätt som gör det möjligt att beskriva tumörtillväxt i längdskalor som är relevanta för kliniska tillämpningar. Koden och en detaljerad användarmanual är öppna och tillgängliga för allmänheten, i hopp om att ytterligare användning och förbättringar kommer att påskynda framsteg och upptäckt inom området.

I denna EPJE Tips och tricks papper författarna presenterar de tekniska aspekterna efter arbetsflödet av en typisk simuleringsprocedur. Det är viktigt att deras tillvägagångssätt tillåter studier av topologiska och funktionella aspekter samtidigt, som är relevant för terapeutiska behandlingar.

Tumörkodens källkod är tillgänglig under öppen källkodslicens på:https://github.com/thierry3000/tumorcode