Förlust av Setdb1 i endoderm leder till starka utvecklingsdefekter under embryogenes. en sidovy av kontroll och Setdb1 END embryon vid E7.5 (sena knoppstadiet), E7.75 (huvudveckstadiet), E8.5 (~6 somit) och E9. Inga synliga utvecklingsfel kan upptäckas i Setdb1 END embryon från E7.5 till E8.0. Setdb1 END embryon visar en axelvridningsdefekt som visar sig från E8.5 och leder till kraftig bakre trunkering vid E9.0. Representativa bilder från n = 3 per genotyp och stadium. b Sidovy av E7.5-kontroll och Setdb1 END embryon färgade med Foxa2- och Sox17-antikroppar (framtill till vänster). Närvaron av båda markörerna indikerar att endodermceller kan bildas i Setdb1 END embryon. Representativa bilder från n = 3 per genotyp och stadium. c Hematoxylin/Eosin-färgning av tvärsnitt av E8.5 och E9.0 kontroll och Setdb1 END embryon. De ungefärliga positionerna för sektionerna anges i schemat. Den svarta rektangeln markerar området som används för förstoring. Röda pilar indikerar baktarmsregionen. De svarta pilspetsarna markerar neuralröret. Representativa bilder från n = 3 per genotyp och stadium. Kredit:Nature Communications (2022). DOI:10.1038/s41467-022-32978-7
LMU molekylärbiolog Gunnar Schotta har undersökt vilka mekanismer som förhindrar att endogena retrovirus blir alltför aktiva.
Endogena retrovirus (ERV) har etablerat sig i det mänskliga genomet under evolutionens gång och spelar en viktig roll i normal genreglering. Överdriven ERV-aktivitet kan dock leda till sjukdomar som autoimmunitet och cancer. Och så har celler utvecklat mekanismer för att känna igen och tysta endogena retrovirus.
Tystnaden åstadkoms genom att paketera motsvarande DNA-sektioner i en mindre tillgänglig struktur. Denna process underlättas av modifieringar av histonproteinerna som packar DNA:t (H3K9me3) och en modifiering av själva DNA:t (DNA-metylering). Det har dock inte varit klart tidigare, vilka av dessa modifieringar som är riktigt viktiga för ERV-ljudämpning.
Teamet – ledd av Gunnar Schotta från LMU:s Biomedicinska Centrum München – har funnit att i vissa celltyper är DNA-metylering avgörande och närvaron av H3K9me3 är inte tillräcklig för att tysta ERV. Denna upptäckt ger en viktig grund, till exempel för undersökningen av avvikande aktiverade ERV i samband med sjukdomar som cancer och autoimmunitet.
Studien publicerades i Nature Communications . + Utforska vidare
