Mikroorganismer är encelliga varelser som bakterier, svampar eller mögel. Dessa organismer tenderar att reproducera och växa i grupper, så i stället för att titta på varje cell på egen hand studerar mikrobiologer arrangemanget av cellerna. Arrangemanget av kolonier av organismer som bakterier gör det möjligt för mikrobiologer att identifiera dem, eftersom dessa mikroorganismer tenderar att växa i specifika mönster. . Runda bakterier, kända som cocci eller coccus för en cell, kan också vara ovala, långsträckta eller platta på ena sidan. Bacilli, eller den enskilda bacillusen, är stavformade organismer som också kan se så korta och tjocka att de kallas coccobacillus. Spiralbakterier kan se ut böjda, när de kallas vibrios, eller har flera vändningar - spirilla har styva kroppar medan spiroketer är flexibla. Medan dessa tre grundläggande former är de viktigaste som bakterier antar, kan pleomorfiska bakterier ha olika former som rutor eller stjärnor.
Klassificeringsarrangemang

Bakterier är ordnade i mönster, av vilka de vanligaste är diplo, stafyl, strepto, tetrad och sarcina; dessa arrangemang kan appliceras på de olika bakterieformerna. Diplo hänvisar till två celler, så diplokocker är arrangemang av cocci i par. Streptobaciller är baciller i kedjor. Staphylococci är kockar arrangerade i oregelbundna kluster, som en massa druvor. En tetrad är en grupp av fyra celler arrangerade på en kvadrat, och sarcina är arrangerade i kuber med åtta celler. Cocci kan ordnas i alla dessa former: baciller kan vara enkla, streptobaciller eller coccobacilli; och spiralbakterier finns i formerna vibrio, spirillum och spirochete.
Morfologi

Mikrobiologer kan också identifiera bakterier genom deras kolonimorfologi, eller utseendet och egenskaperna hos bakteriekolonin. Medan arrangemang hänför sig till grupperingarna av enskilda celler, beskriver morfologi uppkomsten av grupper av bakterier eller kolonier. Koloniformer kan vara runda, oregelbundna, filamentösa eller krullade. Kolonier kan vara platta eller ha en rundad höjd. Ytan på en koloni kan verka slät, glänsande, grov eller tråkig, och opaciteten kan vara transparent, ogenomskinlig eller genomskinlig. tenderar att ordna sina celler i specifika former. Svampar, till exempel, kan visas som flercellformiga trådformar, makroskopiska filamentösa svampar (ofta kallade svampar) eller encelliga jästar. Formar består av trådar som kallas hyfer; cellerna i formar fortsätter att reproducera för att bilda kedjor. Hyferna bildar grupper av trådar som kallas mycelia (singular mycelium). Makroskopiska svampar bildar också mycelier, men de producerar också synliga strukturer som svamp eller paddestolar som håller sporer, vilket gör att svamparna kan reproducera sig. Jäst reproduceras av spirande dotterceller från en modercell.