1. Ofullständiga eller felmärkta referensdatabaser:Noggrannheten hos DNA-streckkoder är starkt beroende av att referenssekvenserna är heltäckande och korrekta. Om referensdatabasen är ofullständig eller innehåller felmärkta sekvenser kan det leda till felaktiga identifieringar. Detta är särskilt utmanande för nyupptäckta eller dåligt studerade arter som kanske inte finns representerade i databasen.
2. Intraspecifik variation:DNA-streckkodsnoggrannheten förutsätter att genetisk variation inom en art (intraspecifik variation) är lägre jämfört med genetisk divergens mellan arter (interspecifik variation). I vissa fall kan dock intraspecifik variation vara hög, vilket leder till överlappningar mellan arternas DNA-streckkodssekvenser. Detta kan göra det svårt att skilja mellan närbesläktade eller kryptiska arter.
3. Hybridindivider:Hybridisering, korsning av olika arter, kan resultera i individer med blandad genetisk bakgrund. Att analysera DNA-streckkoder från hybridindivider kan vara utmanande eftersom de kan uppvisa mellanliggande eller mosaikmönster, vilket gör det svårt att tilldela dem till en enda art.
4. Urgammalt eller nedbrutet DNA:När man arbetar med forntida eller nedbrutna DNA-prover kan kvaliteten och kvantiteten av erhållet DNA äventyras. Detta kan påverka noggrannheten i DNA-streckkodningen, eftersom nedbrutet DNA kan ha saknade eller skadade sekvenser som kan påverka artidentifieringen.
5. Miljöförorening:Provtagning av miljö-DNA (eDNA) involverar insamling av genetiskt material från miljökällor som jord, vatten eller luft. Emellertid är eDNA-prover känsliga för kontaminering från icke-målorganismer, vilket leder till falska positiva eller felaktig artidentifiering.
6. Mitokondriell introgression:I vissa fall kan mitokondriellt DNA (som ofta används för DNA-streckkodning) överföras mellan arter genom hybridisering eller andra evolutionära processer. Detta fenomen, känt som mitokondriell introgression, kan resultera i oenighet mellan artens evolutionära historia och DNA-streckkodssekvensen, vilket potentiellt kan leda till felaktiga artidentifieringar.
Det är viktigt att känna igen begränsningarna och potentiella felkällor vid tolkning av DNA-streckkodsresultat. Forskare använder ofta ytterligare bevis, såsom morfologisk analys, ekologiska data och nukleära DNA-sekvenser, för att bekräfta och validera DNA-streckkodsidentifikationer, särskilt när de hanterar utmanande eller osäkra fall.
