De troende avvisar ofta tanken att religion kan förklaras fullt ut med hjärnledningar eller andra vetenskapliga förklaringar. De hävdar att religiösa erfarenheter och övertygelser går utöver vetenskaplig förståelse och involverar en transcendent dimension som inte kan fångas av rent materiella förklaringar. Medan neurovetenskap kan ge insikter i vissa aspekter av religiös upplevelse, såsom inverkan av neurala mekanismer på känslor och andlighet, hävdar många troende att religionen har mer än bara hjärnaktivitet.