Ett virus som invaderar bakterier kallas en bakteriofag, eller helt enkelt en fag. Bakteriofager är en typ av virus som specifikt infekterar och replikerar inom bakterier, liknande hur virus infekterar och replikerar i djurceller. De är mycket små, även jämfört med bakterier, och kan endast observeras med ett elektronmikroskop. Bakteriofager har förmågan att infektera och lysera specifika bakteriella värdstammar. De består vanligtvis av ett proteinhölje som omsluter ett DNA- eller RNA-genom. Vid infektion injicerar en bakteriofag sitt genetiska material i värdbakterien, vilket i huvudsak kapar bakteriens cellulära maskineri för att producera fler kopior av fagen. De nyproducerade fagerna lämnar sedan värdcellen, vilket ofta får cellen att brista (lysera) och frigöra fler fager i miljön. Bakteriofager är mycket specifika i sitt värdområde, vilket innebär att de bara kan infektera och replikera inom vissa typer av bakterier.