Processen med binär klyvning börjar med replikeringen av den bakteriella kromosomen. De replikerade kromosomerna fästs sedan på cellmembranet. Cellmembranet klämmer sedan ihop i mitten och delar cellen i två dotterceller. Varje dottercell får en av de replikerade kromosomerna.
Binär klyvning är ett mycket effektivt sätt för bakterier att föröka sig. Det tillåter dem att snabbt öka sitt antal, även i tuffa miljöer. Vissa bakterier kan föröka sig genom binär fission var 20:e minut eller så.
Förutom binär fission kan vissa bakterier också reproducera sig genom en process som kallas sporulering. Sporulation uppstår när en bakterie producerar en spor, som är en vilande cell som kan överleva svåra förhållanden. När förhållandena förbättras kan sporen gro och växa till en ny bakterie.