* Hög fruktbarhet: Fruktflugor producerar ett stort antal avkommor, vilket ger en stor provstorlek för genetiska studier. Detta gör att forskare kan upptäcka även små genetiska effekter.
* Enkel kultur: Fruktflugor är lätta att odla och underhålla i laboratoriet. De kan matas på enkla media och kräver inte mycket utrymme. Detta gör dem till en kostnadseffektiv organism för att studera arv.
* Välförstådd genetik: Fruktflugornas genetik är välkänd, och ett stort antal genetiska verktyg finns tillgängliga för att studera dem. Detta gör det möjligt att exakt manipulera generna hos fruktflugor och att studera effekterna av specifika mutationer.
* Många väl studerade naturliga varianter finns: Naturliga varianter av fruktflugor finns för många genetiska egenskaper, vilket gör det möjligt för forskare att enkelt undersöka många ärftliga fenotyper och deras underliggande orsaker.
På grund av dessa fördelar har fruktflugor använts för att studera ett brett spektrum av genetiska fenomen, inklusive mendelskt arv, könsbestämning, kromosomernas struktur och funktion och den genetiska grunden för beteende.