Det är emellertid viktigt att notera att klassificeringen av organismer till kungarike ständigt utvecklas. Moderna klassificeringssystem placerar ofta prokaryoter i två separata domäner:
* Bakterier: Dessa är riktiga bakterier, en mångfaldig grupp av encelliga organismer.
* archaea: Dessa är encelliga organismer som ofta finns i extrema miljöer och har unika biokemiska egenskaper.
Medan Monera Kingdom är en traditionell klassificering, är domänsystemet mer allmänt accepterat idag.