Här är en uppdelning av de viktigaste skillnaderna:
prokaryoter:
* Enkel promotorstruktur: Prokaryota promotorer är vanligtvis korta och innehåller två konserverade sekvenser, -10 -rutan (Pribnow -rutan) och -35 -rutan, som känns igen av sigmafaktorn för RNA -polymeras.
* Närhet till transkriptionsstartplatsen: Dessa lådor är belägna relativt nära transkriptionsstartplatsen (cirka -10 och -35 baser uppströms), vilket möjliggör en enkel och effektiv initieringsprocess.
* Direkt interaktion med RNA -polymeras: RNA -polymeras binder direkt till promotorregionen, underlättat av sigmamaktorn som känner igen -10 och -35 -lådorna. Denna direkta interaktion gör det möjligt för transkription att starta snabbt.
eukaryoter:
* Mer komplex promotorstruktur: Eukaryota promotorer är mer komplexa och innehåller ett bredare variation av element, inklusive kärnpromotorn (som innehåller Tata -rutan, initiatorelementet och nedströms promotorelement) och uppströms reglerande element (som förstärkare och ljuddämpare).
* Ytterligare avstånd från transkriptionsstartplatsen: Eukaryota promotorer kan vara belägna mycket längre bort från transkriptionsstartplatsen, ibland till och med tusentals baser uppströms.
* indirekt interaktion med RNA -polymeras: I stället för att direkt binda till promotorn kräver RNA -polymeras II i eukaryoter montering av ett komplex av transkriptionsfaktorer (allmänna transkriptionsfaktorer) för att initiera transkription. Dessa faktorer binder till kärnpromotorelementen och rekryterar RNA -polymeras II.
Varför dessa skillnader finns:
* Komplexitet i genreglering: Eukaryoter har ett mycket mer komplext system för genreglering, som involverar ett bredare utbud av faktorer och regleringsmekanismer. Den komplexa promotorstrukturen och engagemanget av transkriptionsfaktorer möjliggör en högre grad av kontroll över genuttryck.
* Kärnkraftsfack: I eukaryoter sker transkription i kärnan, separerad från översättning i cytoplasma. Denna avdelning kräver mer detaljerade mekanismer för att reglera genuttryck, vilket återspeglas i komplexiteten hos eukaryota promotorer.
* kromatinstruktur: Eukaryot DNA förpackas i kromatin, en komplex struktur av DNA och proteiner. Denna förpackning ger en barriär för transkription och kräver ytterligare mekanismer för åtkomst till DNA. Detta behandlas delvis av den komplexa promotorstrukturen och involvering av transkriptionsfaktorer.
I huvudsak återspeglar skillnaderna i promotorstruktur och positionering de oerhört olika organisatoriska och reglerande utmaningar som prokaryoter och eukaryoter står inför. Eukaryota promotorer är skräddarsydda för att hantera komplikationerna i deras cellulära organisation och genreglering, medan prokaryota promotorer prioriterar effektivitet och direkt interaktion med transkriptionsmaskineriet.
