Dessa är de bredaste kategorierna inom biologisk klassificering och representerar de djupaste evolutionära grenarna. De tre domänerna är:
* Bakterier: Encelliga prokaryoter (saknar en kärna).
* archaea: Encelliga prokaryoter (saknar en kärna) som ofta lever i extrema miljöer.
* eukarya: Organismer med celler som har en kärna och andra membranbundna organeller. Denna domän inkluderar växter, djur, svampar och protister.
Inom varje domän finns det ytterligare klassificeringar, inklusive kungarike, phyla, klasser, order, familjer, släkten och arter.
