Han utvecklade ett system för att klassificera organismer baserat på deras delade egenskaper, som kallas Linnaean taxonomi . Detta system använder en hierarkisk klassificering, med organismer grupperade i alltmer specifika kategorier:
* kungariket
* phylum
* klass
* order
* familj
* släktet
* arter
Linnés verk, publicerad i sin bok Systema Naturae 1735 lägger grunden för det moderna systemet för biologisk klassificering och används fortfarande som grund för att förstå förhållandena mellan levande saker.